蔡政府一改過往反對態度，決定開放美豬美牛進口台灣，引來諸多爭議，對此台北市長柯文哲先是批評決策太突然，同時也希望民進黨政府給民眾一個說法，而宜蘭縣長林姿妙則是再三呼籲中央政府為民眾的健康把關。

(台北市長 柯文哲:
這件事情實在是太突然了，事實上中央政府，事先也沒有跟大家商量，那明年一月又要實施，我覺得實在是，有點霸道你知道，所以更重要是，過去民進黨說不可以，現在說可以，總要說明一下她的理由是什麼。)

(宜蘭縣長 林姿妙:
保障民眾食安問題，這個很重要，第二點我們要加強的標示，商家明確標示，使用美國的豬肉美國的牛肉，還是本地的豬肉還是牛肉，請消費者自己來選擇， 而且營養午餐，只使用台灣的豬肉。)

把時間拉回到2012年，綠營執政的六縣市首長，一起站出來痛批馬政府棄人民健康於不顧，一致譴責要求美牛瘦肉精零檢出。但是到了2020年的民進黨執政，整個政策髮夾彎的原因到底是什麼?連過去帶頭反對的農委會主委陳吉仲，現在也支持開放，1號一早陳吉仲在接受了綠色和平廣播電台專訪時，也對此說明。

(農委會主委 陳吉仲:
那時候台灣還是口蹄疫疫區，我們的豬肉沒辦法出口，我們口蹄疫拔針，(是在)2020年6月18號，所以我們的豬肉現在可以外銷了，如果像這麼重大的這樣的一個(開放)政策，一定要完整的配套措施，其實蔡英文總統跟蘇貞昌院長，已經將所有的配套措施，已經準備好了，所有的進口的豬肉，全部都要強制標示。)

針對臺灣養豬業者是否受到衝擊？他也掛保證，為了協助國內養豬產業向上提升，將提撥百億養豬產業基金，確保國內的毛豬拍賣價格維持在一定水準，只是這錢到底怎麼運用？目前則未說明清楚，必須和各地養豬協會共商後決議。