疫情指揮中心在開設近1200天之後，將走入歷史。指揮官王必勝宣布，5月1日開始防疫降階，指揮中心將解編，新冠肺炎也會同步從第5類法定傳染病，降為第4類。未來民眾快篩陽性，還是可以實體看診，而抗病毒等藥物依然是公費給付。至於醫療與照護機構，還有救護車等場所的口罩令，會持續到5月底再來檢視。

因應新冠肺炎，成立3年、超過1000天的疫情指揮中心，終於要退場了。行政院長陳建仁25日下午親自到指揮中心聽取簡報後，點頭同意指揮中心降級解編的規劃，指揮中心將在5月1日正式解編，走入歷史。

(行政院長 陳建仁:
剛才的這個會議上，我也聆聽了我們，中央流行疫情指揮中心，所提出來的降級解編的，這樣的一個規劃，我也同意他們的規劃)

指揮中心退場後，新冠肺炎也將同步從第5類法定傳染病降為第4類，跟流感一樣，實名制家用快篩劑也將跟著退場。外界關心，未來民眾確診時該如何就醫？指揮中心表示，快篩陽性民眾仍可到醫療院所實體看診，口服抗病毒藥物及清冠一號等藥物，仍然是公費給付。

(疫情指揮中心發言人 羅一鈞:
在醫療照護的部分，事實上在這個解編降階前後，是沒有調整的，輕症仍然是由公費繼續提供，口服抗病毒藥物跟清冠一號，然後在這個長新冠部分的，這個染疫康復者門診仍然會持續)

至於公費新冠疫苗，民眾還是可以到各合約醫療院所接種，但5月1日起醫療院所可以收取疫苗接種掛號費。而口罩令部分，目前僅剩醫療照護機構和救護車等兩大場所必須必強制戴口罩，政策將維持到5月底再進行檢視。