就是擔憂疫情蔓延部落，波及長者與小孩健康，許多部落採取強硬態度，禁止外人進入卻引發衝突。但翻開國內法條，部落杜絕遊客作為，並無法源依據，因此也讓部落防疫管制站的權責受到質疑。

對於部落所做出的自主管理，原民會也呼籲遊客，非必要不要進入部落，並函請各地方政府，依據傳染病防治法，針對轄內原住民族地區，評估管制站相關措施。而疾管署也呼籲國人，減少人流移動。

(疾管署副署長 莊人祥：
這個在我們法制小組的評估下，它並不具強制力，也請他們要注意進出民眾的配合意願，我們這邊也希望說，遊客可以考量原民部落，為了要維護他們健康，請遊客也儘量配合 )

不過已有原鄉地區陸續傳出確診個案，恐怕衝擊原鄉醫療量能，疾管署表示，若疫情發生將即時通知地方政府，補充醫療人力及資源。

(疾管署副署長 莊人祥：
當然就是說要防範未然，但是如果一旦有疫情，那我們會督導相關的衛生局，或是縣市政府，盡力保住原住民的健康，擴大篩檢的力度 )

但這次疫情來勢洶洶，評估目前疫情狀況，近兩周內就已有4,818例本土確診，疫情仍未趨緩， 現階段疾管署針對社區篩檢站，及通報措施等五大面向，進行強化，希望能有效降緩疫情擴散。