(中央流行疫情中心指揮官 陳時中：
我們會發函撤銷他的公告。)

金門、澎湖、與馬祖分別公告，要求所有旅客六月起需快篩陰性才能進入這三個離島，再度遭到指揮官陳時中，以違反傳染病防治法的理由撤銷公告。陳時中認為目前要求14天無症狀、或五個機場快篩陰性才能搭機到離島的機制已經足夠。

(中央流行疫情中心指揮官 陳時中：
我們還是非常的擔憂，這裡面的偽陰性、偽陽性造成一種假性的安全感，對於過往的一個 就是一個病史， 或者就是說，相關的症狀沒有配合起來一起看，其實他還是有風險。)

三個離島縣政府從電視上聽到指揮官在記者會發出的命令後，都馬上緊急開會，最後三個縣政府都決定尊重中央，但機場全面快篩繼續做下去。

(澎湖縣府發言人 陳其育：
如果中央沒辦法保護澎湖，請不要阻擋澎湖自我保護，因此澎湖縣政府依然會，持續對所有入境澎湖的旅客採取全面地快篩。)

(金門縣長 楊鎮浯：
所以我們三個離島都會按照既定的步驟來做，當然不會違背中央的法令，但是我們會循自我體系內，可以加強強度，加強密度的方式，來確實我們的旅客配合做篩檢的動作。)

但由於立法院星期一通過紓困振興特別條例時有附帶決議，入境離島者全面篩檢，國民黨立院黨團質疑陳時中違反國會決議。

(電訪 國民黨立院黨團首席副書記長 陳玉珍：
立法院院會所通過的附帶決議，也是在離島各機場及港口設置快篩站，並且全面的做篩檢，籲請疫情指揮中心這邊，不要做陽奉陰違的動作。)

對於地方的反彈聲音，行政院長蘇貞昌也透過發言人發出聲明表示，基於防疫一致性，不能產生混亂雜沓、國中有國的亂象，也徒增旅客的困擾。蘇貞昌說交通部民航局已在五個飛往離島航班的機場增設篩檢站，加強對有症狀者篩檢，政府會從本島的航空站就做好防護。